حكومة ميجي في اليابان (باليابانية: 政府 政府) هي الحكومة التي شكّلها السياسيون في مقاطعة ساتسوما ومقاطعة تشوشو في ستينيات القرن التاسع عشر. تُعد حكومة ميجي أول حكومة لإمبراطورية اليابان.
يُعرف السياسيون في حكومة ميجي باسم الأوليغارشية في ميجي، وهم الذين أطاحوا بشوغونية توكوغاوا.