حكومة ماليزيا وتسمى رسميًا الحكومة الاتحادية لماليزيا (بالملايوية: Kerajaan Persekutuan Malaysia)، يقع مقرها في إقليم بوتراجاي الفيدرالي باستثناء الفرع التشريعي الموجود في كوالالمبور. ماليزيا اتحاد فيدرالي من 13 ولاية تعمل ضمن ملكية دستورية في ظل نظام وستمنستر البرلماني وتصنف على أنها ديمقراطية تمثيلية. تلتزم الحكومة الفيدرالية الماليزية بالدستور الفيدرالي لماليزيا، وهو القانون الأعلى في البلاد، وقد تم إنشاؤه بموجب هذا الدستور.
تتبنى الحكومة الفيدرالية مبدأ الفصل بين السلطات بموجب المادة 127 من الدستور الاتحادي، ولها ثلاثة فروع: التنفيذية والتشريعية والقضائية. لدى حكومات الولايات في ماليزيا أيضًا هيئاتها التنفيذية والتشريعية. النظام القضائي في ماليزيا هو نظام محاكم اتحادي يعمل بشكل موحد في جميع أنحاء البلاد.