حرب الكونغو الثانية (والمعروفة أيضًا باسم حرب إفريقيا العظيمة) هي حرب بدأت في أغسطس عام 1998، بعد أقل من سنة من نهاية حرب الكونغو الأولى والتي اشتملت على القضايا ذاتها، في جمهورية الكونغو الديموقراطية (التي كانت تسمى سابقًا زائير) وانتهت رسميًا في يوليو 2003 عند تولي الحكومة الانتقالية لجمهورية الكونغو الديموقراطية السلطة؛ على الرغم من استمرار العداوات حتى الآن.
وتعد هذه أكثر الحروب دموية في التاريخ الإفريقي الحديث، حيث شاركت فيها ثماني دول إفريقية، فضلاً عن 25 مجموعة مسلحة تقريبًا. وبحلول عام 2008، أسفرت الحرب وتوابعها عن وفاة 5.4 ملايين شخص، مات معظمهم بسبب المرض والمجاعة.