حاكم طوكيو (باليابانية: 東京都知事، تُنطق: Tōkyō-To Chiji) هو رئيس حكومة طوكيو.
تأسس منصب الحاكم في عام 1943، بعد توحيد مدينة طوكيو ومحافظة طوكيو في حكومة طوكيو الحضرية. قبل ذلك، كان للمحافظة محافظ بينما كان للمدينة عمدة. اعتمد اللقب الحالي في عام 1947 بسبب إصدار قانون الحكم المحلي.