شاركت جزر القمر في الألعاب الأولمبية الصيفية 2020 التي أقيمت في طوكيو. كانت هذه الألعاب مجدولة أصلا من 24 يوليو إلى 9 أغسطس 2020، لكنها تأجلت لاحقا إلى الفترة من 23 يوليو إلى 8 أغسطس 2021 بسبب جائحة كوفيد-19.
في دورة طوكيو، مثل جزر القمر ثلاثة رياضيين تنافسوا في رياضتين مختلفتين. وقد شغل كل من أميد إلنا وفادان حمادي دور حاملي علم البلاد في مراسم افتتاح الألعاب، بينما حملت حمادي العلم أيضًا في مراسم الاختتام. ولم تفز جزر القمر بأي ميداليات في هذه الألعاب.