جامعة ليون (بالفرنسية: Université de Lyon) هي جامعة فرنسية مقرها في مدينة ليون الفرنسية، وهي مركز للتعليم العالي والبحث العلمي، تتكون من 16 كلية ومعهداً للتعليم العالي، والأفرع الثلاثة الرئيسية لجامعة ليون هي:
جامعة كلود برنار في ليون: وتهتم بدراسة العلوم والصحة، ويدرس بها حوالي 27 ألف طالب.
جامعة لوميير في ليون: وتهتم بدراسة العلوم الاجتماعية، وتضم حوالي 30 ألف طالب.
جامعة جان مولان في ليون: وتهتم بالإنسانيات والقانون، ويدرس بها حوالي 20 ألف طالب.