جامعة غاكوشوين (باليابانية: 学習院大学، بالروماجي: Gakushūin Daigaku) هي جامعة يابانية خاصة تقع في ميجيرو، منطقة حي توشيما في طوكيو، أعيد بناؤها بعد الحرب العالمية الثانية كفرع لمؤسسة غاكوشوين التعليمية، السلف السابق لهذه الجامعة بُني خلال حقبة ميجي لتعليم أبناء النبلاء اليابانيين، ولا تزال واحدة من أعرق جامعات اليابان، درس في هذه الجامعة وتخرج منها أغلب أفراد البيت الإمبراطوري الياباني.
عدد الطلاب في جامعة غاكوشوين يتم إختياره بعناية بحيث يضمن أن يتلقى كل طالب إهتمامًا شخصيًا من طاقم عمل الجامعة.