يقع جامع الشيخ بمدينة حومة السوق بجزيرة جربة، ويعود تاريخ بناء هذا الجامع إلى القرن 10 هجري تقريبًا، أي قبل سنة 953 هجري / 1547 ميلادي على يد الشيخ صالح بن يحيى بن زكرياء السمومني. ومع كثرة البناء في السوق وزيادة السكان، زيد فيه سنة 1028 هجري على يد الشيخ أبو القاسم بن سعيد اليونسي، والشيخ أبو زيد من أولاد أبي زيد، والشيخ إلياس، بمساعدة جماعة الوهبية. ثم تم توسيعه مرة أخرى خلال القرن 20 ميلادي في الربع الأخير منه حوالي سنة 1399 هجري / 1978 ميلادي، وأنفق عليه أهالي الجزيرة، من بينهم الشيخ الفقيه قاسم بن عمر قوجة.
كما أقيمت بهذا المسجد أول صلاة جمعة بجربة سنة 1079 هجري / 1668 ميلادي، في فترة حكم موسى بن سعيد بن عمر بن جلود للجزيرة. وهذا ما يؤكده الشيخ سليمان الحيلاتي في رسائله قائلاً: «أمر شيخ البلاد، وهو أنذاك موسى بن سعيد البجلودي، حاكم جربة للفقهاء، أن يصلّوا الجمعة الأولى من شهر صفر سنة تسع وسبعين وألف في مسجد الشيخ بحومة السوق. وكانت بدايتهم فيه الجمعة الأولى من شهر صفر 1079، وهؤلاء الفقهاء هم فقهاء عائلة اليونسي إذ هم كتاب أمراء بني الجلود وعدولهم»