خلال فترة الاستعمار الإسباني للفلبين، 1521-1898، قامت ثورات متعددة ضد الحكومة الاستعمارية الإسبانية من قبل السكان الأصليين للمنطقة وهم شعوب مورو ولوماد والهنود والصينيين (سانغلي) وأيضًا من قبل الإنسولار (الفلبينيين من أصل إسباني خالص أو شبه خالص، يعرفون باسم كريولو)، كان الهدف الأهم لهذه الثورات استعادة الحقوق والسلطة التي كانت تنتمي تقليديًا للتيموي زعماء اللوماد، والراجا زعماء الماجينو، والداتوس زعماء المورو. كانت المشاكل المتعلقة بالأراضي سببًا لبعض حركات التمرد كما حدث في المقاطعات الزراعية في باتانغاس وبولاكان وكافيت ولاغونا. تمرد السكان الأصليون أيضًا بسبب الضرائب الجائرة والعمل القسري.
فشلت معظم هذه الثورات بسبب انحياز غالبية السكان المحليين إلى الحكومة الاستعمارية المسلحة جيدًا، ومشاركتهم في إخماد الثورات بصفة جنود مشاة لصالح الإسبان.
واصل شعب مورو وحلفاؤه الكفاح من أجل السيادة في مينداناو وسولو طوال فترة الاحتلال والحكم الإسباني.