تشير ثنائية الجنس - عند البشر والحيوانات - إلى الاختلافات في الخصائص الجنسية بما في ذلك الكروموسومات أو الغدد التناسلية أو الهرمونات الجنسية أو الأعضاء التناسلية التي «لا تتناسب مع المفاهيم الثنائية النموذجية لأجسام الذكور أو الإناث» وفقًا لمكتب المفوضية السامية للأمم المتحدة لحقوق الإنسان. سُمي ثنائيو الجنس بأسماء عدة عبر التاريخ كالمخنثين أو «المخصيين خلقيًا» أو حتى «باردو الجنس» خلقيًا. لم تعد مثل هذه المصطلحات محبذةً، وتعتبر الآن مضللة ووصمة.
اختلفت معاملة ثنائيي الجنس باختلاف الثقافات. كان وجود ثنائيي الجنس معروفًا للعديد من الثقافات والأنظمة القانونية القديمة وما قبل الحديثة، سواء عوملوا بتسامح أو كانوا مقبولين اجتماعيًا من قبل ثقافة معينة، وهناك العديد من الروايات التاريخية حول ذلك.