توموكو أوتا (اليابانية: 太田 朋子)، هي عالمة يابانية وأستاذة فخرية في المعهد الوطني لعلم الوراثة، ولدت توماكو هارادا (اليابانية: 原田 朋子) في 7 سبتمبر 1933، في ميوشي في محافظة آيتشي، تعمل توموكو في علم الوراثة السكانية / التطور الجزيئي وهي معروفة بتطوير نظرية التطور شبه المحايدة.
حصلت توموكو على العديد من الجوائز، بما في ذلك وسام الثقافة الياباني (2016)، في عام 2015، مُنح كوموتو وريتشارد ليونتين جائزة كرافورد بشكل مشترك "لتحليلاتهما الرائدة ومساهماتهما الأساسية في فهم التعدد الشكلي الجيني".