التنقيب الحيوي أو التنقيب الأحيائي أو التنقيب البيولوجي (بالإنجليزية: Bioprospecting)، عملية اكتشاف منتجات جديدة وإدخالها إلى السوق بناءً على موارد حيوية. يمكن أن تكون هذه الموارد أو المركبات مهمة ومفيدة في العديد من المجالات بما فيها الصناعة الدوائية والزراعة والمعالجة الحيوية للبيئة والتقنية النانوية ومجالات أخرى. كان ثلث الكيانات الجزيئية الكيميائية الصغيرة الجديدة الموافق عليها من قبل الإدارة الأمريكية للطعام والدواء (إف دي إيه) بين عامي 1981-2010 إما منتجات طبيعية أو مركبات مشتقة من منتجات طبيعية. رغم كون العلوم التقليدية (القَبلية) مفيدة بشكل حدسي، فإن التنقيب الحيوي لم يبدأ إلا حديثًا بإشراك هكذا علوم في تركيز جهود البحث عن مركبات نشطة حيويًّا.
قد يشمل التنقيب الحيوي القرصنة الحيوية، وهو استغلال الأشكال التقليدية للمعارف بوسائل تجارية، ويمكن أن يشمل إصدار براءات اختراع لموارد طبيعية تستعمل بكثرة أساسًا، كأنواع من النباتات، من قبل هيئات تجارية.