تلوث بين كوكبي (بالإنجليزية: Interplanetary contamination)، مصطلح يشير إلى التلوث البيولوجي لأحد الأجرام الكوكبية بواسطة مسبار فضائي أو مركبة فضائية، إما بقصد أو دون قصد.
يوجد نوعان من التلوث بين الكوكبي:
التلوث الأمامي، وهو انتقال الحياة وأشكال التلوث الأخرى من الأرض إلى الأجرام الفلكية الأخرى.
التلوث الخلفي، وهو انتقال الكائنات الحية وأشكال التلوث الأخرى، غير الأرضية، إلى المحيط الحيوي للأرض. ويشمل هذا النوع أيضًا انتقال العدوى إلى البشر والمساكن البشرية الموجودة في الفضاء وعلى الأجرام الفلكية الأخرى بواسطة الكائنات الحية غير الأرضية، وذلك في حالة وجود مثل هذه المساكن.
يتوجه التركيز الرئيسي إلى الحياة الميكروبية والأنواع المحتمل أن تكون أنواعًا مجتاحةً. اتُخذت أشكال التلوث الأخرى غير البيولوجية أيضًا في الاعتبار، بما يشمل تلوث الرواسب الحساسة ذات الأهمية العلمية، مثل الرواسب الجليدية القطبية بالقمر. وفي حالة التلوث الخلفي، تعتبر احتمالية وجود الحياة متعددة الخلايا ضئيلةً، ولكنها لم تُستبعد. وفي حالة التلوث الأمامي، تعتبر احتمالية التلوث بواسطة الحياة متعددة الخلايا، مثل الأشنيات، ضئيلةً في المهام الروبوتية، ولكنها ستؤخذ في الاعتبار في البعثات المأهولة إلى المريخ.
تخضع المهمات الفضائية الحالية لمعاهدة الفضاء الخارجي وإرشادات لجنة أبحاث الفضاء للحماية الكوكبية. يمكن الوقاية من التلوث الأمامي عن طريق تعقيم المركبات الفضائية بشكل رئيسي. وفي حالة مهمات العودة بالعينات (التلوث الخلفي)، التي تهدف فيها المهمة إلى العودة بالعينات الفضائية غير الأرضية إلى الأرض، سيقلل تعقيم هذه العينات من أهميتها العلمية بشكل كبير. ولهذا، يمكن الوقاية من التلوث الخلفي بشكل رئيسي عن طريق احتواء العينات، وكسر سلسلة الاتصال بين كوكبها الأصلي وكوكب الأرض. وسنحتاج إلى تطبيق إجراءات الحجر الصحي أيضًا على هذه المواد وعلى أي شخص كان على اتصال بها.