يمثل تغير المناخ تهديدًا كبيرًا للبيئة والسكان في مدغشقر. أدى تغير المناخ إلى ارتفاع درجات الحرارة، وتطاول موسم الجفاف، وازدياد شدة العواصف الاستوائية. وصل تأثير تغير المناخ للنظام البيئي والحياة الحيوانية والنباتية.
تشير التوقعات إلى تراجع الشعاب المرجانية وموائل الغابات بسبب تأثير تغير المناخ الذي يهدد أيضًا الأنواع المحلية مثل الليمور. يتأثر سكان مدغشقر بتغير المناخ نتيجة تأثيره الشديد على المياه والزراعة مع ما يترتب عليه من آثار على الأمن الغذائي. تزداد أيضًا الأمراض المعدية. مدغشقر هي إحدى الدول الموقعة على اتفاقية باريس وقد حددت أهدافًا للتكيف مع تغير المناخ، على الرغم من ذلك تواجه البلاد الكثير من التحديات بسبب الفقر النسبي المنتشر في البلاد.