المجموعة د من مسابقة تصفيات كأس الأمم الأفريقية لكرة القدم 2017 كانت واحدة من المجموعات الـ13 لتحديد الفرق التي تتأهل إلى نهائيات مسابقة كأس الأمم الأفريقية لكرة القدم 2017. تألفت المجموعة من أربعة فرق: بوركينا فاسو، أوغندا، بوتسوانا، وجزر القمر.
لعبت الفرق ضد بعضها البعض ذهاباً وإياباً بنظام التحدي، بين يونيو 2015 وسبتمبر 2016.
الفائزة بالمجموعة، بوركينا فاسو، تأهلت إلى كأس الأمم الأفريقية لكرة القدم 2017، بينما تأهلت أوغندا أيضًا نظراً لكونها حلت كأحد الوصيفين من حيث السجل الأفضل.