بدأت تصفيات كأس آسيا 2007 في أواخر 2005 وانتهت بلعب مرحلة نهائية بين شهري فبراير ونوفمبر 2006 بمشاركة 25 منتخب.
لم تستفد اليابان حاملة اللقب من بطاقة التأهل المباشرة التي ألغيت لأول مرة وأضطر لخوض التصفيات المؤهلة. إنضم أفضل فريقين من كل مجموعة إلى البلدان الأربعة المستضيفة (إندونيسيا وتايلاند وفيتنام وماليزيا) الذين تأهلوا بشكل مباشر.