في القرن التاسع عشر، بدأت النهضة الوطنية في البلقان؛ تأجج التناحر الوطني والديني، وتفاقم النزاع نتيجة سياسة العثمانيين في تحريض فريق على الآخر. في هذه الأثناء، فقدت الإمبراطورية العثمانية سيطرتها على الأقسام الأساسية من اليونان، وصربيا، وبلغاريا، اللاتي طالبت كل منها بمقدونيا لأسباب تاريخية أو إثنية.
في معاهدة سان ستيفانو (عام 1878)، التي وضعت نهاية للحرب الروسية العثمانية (في عامي 1877 و1878)، مُنحت بلغاريا حصة الأسد من مقدونيا. ومع ذلك، فقد ألغت القوى الأوروبية الاتفاقية في العام نفسه (إنظر مؤتمر برلين)، وبقيت مقدونيا تحت الحكم العثماني المباشر.
بعد الحرب العثمانية اليونانية في عام 1897، التي ثبت أنها كانت كارثية بالنسبة لليونان، بدأت القومية البلغارية بالتمكن في مقدونيا. بالتالي، حدثت انتفاضة مقدونية في يوم عيد النبي إيليا (20 يوليو) من عام 1903، عُرفت باسم انتفاضة إيليندن، وسُرعان ما كبحها الجيش العثماني.