يعود تاريخ اليهود في كرواتيا إلى أواخر القرن الثالث، لكن بقيت المعلومات عن المجتمع اليهودي شحيحةً حتى القرنين العاشر والخامس عشر.
بلغ عدد أفراد المجتمع اليهودي نحو 20 ألف فرد بحلول اندلاع الحرب العالمية الثانية، وقُتل معظمهم نتيجة الهولوكوست في دولة كرواتيا المستقلة التي كانت دولةً دميةً تابعةً للنازية.
قرّر نصف الناجين الاستقرار في إسرائيل بعد الحرب العالمية الثانية، في حين فضّل ما يقارب 2500 فرد البقاء في كرواتيا.
استنادًا إلى التعداد السكاني لعام 2011، وُجد 509 يهودي في كرواتيا، لكن يُعتَقد أن هذا الرقم يستثني اليهود الذين وُلدوا من زيجات مختلطة أو المتزوجين من غير اليهود، إذ اندرج أكثر من 80٪ من المجتمع اليهودي في زغرب ضمن هاتين الفئتين حسبما أشارت التقديرات.
تمثل كرواتيا في الوقت الحاضر موطنًا لثمانية معابد يهودية ومنظمات عدة مرتبطة بها في كل من زغرب، ورييكا، وأوسييك، وسبليت، ودوبروفنيك، وتشاكوفيتش، وداروفار، وسلافونسكي برود.
يُعتبر المجتمع اليهودي في زغرب أكبر هذه المنظمات وأكثرها نشاطًا، إذ ينظم مناسبات مثل مهرجان زغرب السينمائي السنوي اليهودي بهدف النهوض بالثقافة اليهودية وهويتها.