بُنيت معظم خطوط السكك الحديدية في إندونيسيا خلال فترة الحكم الاستعماري الهولندي. وبعد الاستقلال في عام 1945، هُجر العديد من هذه الخطوط. وقد تأسس المشغل الوطني الحالي للسكك الحديدية، شركة كيريتا أبي إندونيسيا، في 28 سبتمبر 1945.