البابا بونيفاقيوس الخامس أو بونيفاطيوس الخامس (باللاتينية: Bonifacius V) ـ (توفي في 25 أكتوبر 625) هو بابا الكنيسة الكاثوليكية بين عامي 619 و625.
ينتمي بونيفاقيوس الخامس إلى مدينة نابولي، وقد نُصب بابا للكنيسة الكاثوليكية في 23 ديسمبر 619 بعد مرور أكثر من عام على خلو عرش البابوية بوفاة البابا أديوداتوس الأول في 8 نوفمبر 618.
لعب بونيفاقيوس الخامس دورًا بارزًا في تنصير إنجلترا، وأصدر مرسومًا سمح فيه بلجوء المجرمين إلى الكنائس.
دفن بونيفاقيوس الخامس في كاتدرائية القديس بطرس في 25 أكتوبر 625.