بطليموس السادس فيلوميتر (باليونانية: Πτολεμαῖος Φιλομήτωρ، Ptolemaĩos Philomḗtōr؛ 186–145 ق.م)، كان ملكًا يونانيًا على مصر البطلمية، وحكم في فترتين: الأولى من 180 إلى 164 ق.م، والثانية من 163 إلى 145 ق.م. ويُعتبر غالبًا آخر حاكم لمصر القديمة حين كانت الدولة لا تزال قوة كبرى.
كان بطليموس السادس الابن البكر للملك بطليموس الخامس والملكة كليوباترا الأولى، صعد إلى العرش عن عمر ست سنوات بعد وفاة والده في 180 ق.م. تم إدارة شؤون المملكة من قبل أوصياء، بدءًا بوالدته حتى وفاتها في 178 أو 177 ق.م، ثم تولى اثنان من معاونيها، يوليوس ولينايوس، المسؤولية حتى 169 ق.م. ومنذ 170 ق.م أصبح كل من أخته وزوجته كليوباترا الثانية وأخيه الأصغر بطليموس الثامن حكامًا مشاركين معه.
تميز عهد بطليموس السادس بصراعات خارجية مع الإمبراطورية السلوقية حول سوريا، وصراعات داخلية مع أخيه الأصغر على السيطرة على العرش البطلمي. خلال الحرب السورية السادسة (170–168 ق.م)، تعرضت القوات البطلمية لهزيمة ساحقة، وغزت جيوش السلوقيين مصر مرتين. وبعد بضع سنوات من انتهاء هذا الصراع، تمكن بطليموس الثامن من طرد بطليموس السادس من مصر في 164 ق.م.
ثارت ثورة شعبية في الإسكندرية ضد بطليموس الثامن، ودُعي بطليموس السادس للعودة إلى العرش في 163 ق.م. خلال فترة حكمه الثانية، نجح بطليموس السادس في تثبيت موقفه ضد السلوقيين وأخيه. فقد نُفي بطليموس الثامن إلى قيرينايكا، ومنع من استخدام تلك المنطقة كنقطة انطلاق للسيطرة على قبرص، على الرغم من الدعم الروماني الكبير لصالحه. كما ساعد بطليموس السادس في إشعال صراعات داخلية في الإمبراطورية السلوقية عن طريق دعم مطالبين منافسين للعرش، ما أدى إلى حرب أهلية استمرت لأجيال وأضعفت الأسرة السلوقية في النهاية.
في 145 ق.م، غزا بطليموس السادس سوريا السلوقية وحقق نصرًا كاملًا في معركة أينوپاروس، مما جعله مسيطرًا على المملكة السلوقية والبطلمية معًا. ومع ذلك، أدت الإصابات التي أصيب بها في المعركة إلى وفاته بعد ثلاثة أيام. وفقدت المكاسب التي تحققت من الحرب تقريبًا فورًا، وعاد بطليموس الثامن إلى السلطة.