بطانة القرنية (بالإنجليزية: Corneal endothelium) هي طبقة واحدة من خلية بطانية تتواجد في السطح الداخلي للقرنية، وتقابلها غرفة العين الأمامية الموجودة بين القرنية والقزحية.
تتميز بطانة القرنية بخلايا متخصصة ومسطحة وغنية بالميتوكوندريا والتي بدروها تبطن السطح الخلفي للقرنية، كما أنها تواجه الحجرة الأمامية للعين. تتميز بطانة القرنية بتحكمها في نقل السوائل والمواد المذابة عبر السطح الخلفي للقرنية، كما أنها تحافظ على القرنية في حالة الجفاف الجزئية والتي تعد مهمة للحفاظ على شفافية البصرية.