أدار الاتحاد السوفيتي سرًا أكبر وأطول برنامج للأسلحة البيولوجية وأكثرها تطورًا في العالم، منتهكًا بذلك اتفاقية الأسلحة البيولوجية لعام 1972. بدأ البرنامج في عشرينات القرن العشرين واستمر حتى سبتمبر 1992 على الأقل ولكن من المحتمل أنه استمر في روسيا بعد ذلك.
خلال الحرب العالمية الثانية، أُجبِر جوزيف ستالين على نقل عمليات الحرب البيولوجية (بي دبليو) الخاصة به بعيدًا عن مسار تقدم القوات الألمانية وربما استخدم داء التوليري ضد القوات الألمانية في عام 1942 بالقرب من ستالينجراد.
بحلول عام 1960، كان هناك العديد من مرافق أبحاث الأسلحة البيولوجية في جميع أنحاء الاتحاد السوفيتي. على الرغم من أن الاتحاد السوفيتي وقع على اتفاقية الأسلحة البيولوجية لعام 1972 (بي دبليو سي)، فقد عزز السوفيت فيما بعد برامج الحرب البيولوجية الخاصة بهم. على مدار تاريخه، من المعروف أن البرنامج السوفيتي قد قام بتسليح وتخزين العوامل البيولوجية التالية (واستمر بإجراء أبحاث أساسيًا على العديد من العوامل الأخرى):
العصوية الجمرية
اليرسينيا طاعونية (الطاعون)
الفرنسيسيلة التولارية (داء التوليري)
بيركهولدرية رعامية (الرعام)
البروسيلا (داء البروسيلات)
الكوكسيلة البورنيتية (حمى كيو)
فيروس التهاب دماغ الحصان الفنزويلي (في إي إي)
ذيفان السجقية
الذيفان المعوي نوع بي
الجدري
فيروس ماربورغ
فيروس أورثوبوكس
تطورت هذه البرامج بدرجة كبيرة ونُفذت في عشرات المواقع السرية التي وظفت ما يصل إلى 65000 شخص. مثلًا، تراوحت السعة الإنتاجية السنوية لأسلحة الجدري بين 90 و100 طن. في ثمانينات وتسعينات القرن العشرين، عُدلت العديد من هذه العوامل وراثيًا لتصبح مقاومةً للحرارة والبرودة والمضادات الحيوية. في تسعينات القرن العشرين، اعترف بوريس يلتسين ببرنامج الأسلحة البيولوجية الهجومية وكذلك بحقيقية حادث الأسلحة البيولوجية في سفيردلوفسك عام 1979، الذي أسفر عن مقتل 64 شخص على الأقل. أكد منشقون عن برنامج الأسلحة البيولوجية السوفيتية مثل فلاديمير باشنيك والعقيد كاناتجان أليبيكوف أن البرنامج كان ضخمًا ولا يزال موجودًا. في عام 1992، وُقعت اتفاقية ثلاثية مع الولايات المتحدة والمملكة المتحدة وعدت بإنهاء برامج الأسلحة البيولوجية وتحويل المنشآت إلى أغراض سلمية، لكن الالتزام بالاتفاقية - ومصير العوامل والمرافق البيولوجية السوفيتية السابقة - لا يزال غير موثقًا في الغالب.