بحيرة فرانسيس هي بحيرة تقع في يوكون، كندا. تبلغ مساحتها 9,941 هكتار (24,560 أكر؛ 38.38 ميل2) هي أكبر بحيرة في جنوب شرق يوكون، والأكبر في المنطقة التي لا تصب في نهر يوكون، بل تصب في نهر فرانسيس، ثم في بحر بوفورت عبر نهري ليارد وماكنزي. تقع البحيرة على ارتفاع 734 م (2,408 قدم) قدمًا (113 مترًا).يبلغ متوسط عمقها 31 م (102 قدم) وعمق أقصى يبلغ 93 م (305 قدم).
تتغذى بحيرة فرانسيس بعدة أنهار وجداول تصب فيها، مكوّنة دلتات واسعة عند مصابّها. وقد ورد ذكر البحيرة والمناطق المحيطة بها في السيرة الذاتية لأنطون موني، الصادرة عام 1975 بعنوان "هذا كان الشمال"، كما سُمّي أحد الجداول باسم خور موني تكريمًا لهذا المستوطن الأوّل في المنطقة.