الانسداد الحيوي أو الانسداد البيولوجي (بالإنجليزية: Bioclogging) هو انسداد مساحة المسام في التربة بواسطة الكتلة الحيوية الميكروبية، أجسامهم ومنتجاتهم الثانوية مثل المادة البوليمرية خارج الخلية. تسد الكتلة الحيوية الميكروبية مسار الماء في مساحة المسام، وتشكل سمكاً معيناً للطبقة غير المنفذة في التربة، وتقلل من معدل تسرب المياه بشكل ملحوظ.
يلاحظ الانسداد الحيوي في ظل التسلل المستمر في البرك في ظروف ميدانية مختلفة مثل أحواض التغذية الاصطناعية، وخنادق الترشيح، وقنوات الري، وأنظمة معالجة مياه الصرف الصحي، والأراضي الرطبة المشيدة، وبطانات مدافن النفايات. كما أنه يؤثر على تدفق المياه الجوفية في طبقة المياه الجوفية، مثل المضخات الحرارية ذات المصدر الأرضي، والحواجز التفاعلية القابلة للاختراق، واستعادة النفط المعززة بالميكروبات. في الحالة التي تكون فيها هناك حاجة إلى تسرب المياه بمعدل مناسب، يمكن أن يكون الانسداد الحيوي مشكلة وتُتَّخّذ تدابير مضادة مثل التجفيف المنتظم للنظام. في بعض الحالات، يمكن استخدام الانسداد الحيوي لعمل طبقة غير منفذة لتقليل معدل التسلل.