النقل في الصحراء الغربية محدود للغاية عن طريق البحر والبر والجو، حيث تعتبر الجمال وسيلة النقل الأساسية في المنطقة الصحراوية. يظل النقل البري بالحافلات هو وسيلة النقل الرئيسية.
كانت أجزاء من الصحراء الغربية مستعمرة إسبانية حتى عام 1975 باعتبارها آخر مقاطعة استعمارية في أفريقيا. واندلعت حرب بين تلك الدول وحركة التحرير الوطني الصحراوية، جبهة البوليساريو، التي أعلنت الجمهورية العربية الصحراوية الديمقراطية مع حكومة في المنفى في تندوف، الجزائر. انسحبت موريتانيا في عام 1979، وفي نهاية المطاف تمكن المغرب من السيطرة على معظم الأراضي، بما في ذلك جميع المدن الكبرى والموارد الطبيعية. وتم تنفيذ وقف إطلاق النار بوساطة الأمم المتحدة منذ عام 1997 بين البوليساريو والقوات المغربية.
يعبر أطول قطار شحن في العالم، قطار بضائع السكة الحديدية الموريتانية، الزاوية الجنوبية الشرقية للصحراء الغربية لمسافة قصيرة. وتعطل العبور عبر الصحراء الغربية خلال الحرب بين البوليسارو والقوات المغربية قبل تنفيذ وقف إطلاق النار في عام 1997.