بدأت المرحلة التأهيلية وجولة المباريات الفاصلة في الدوري الأوروبي 2016–17 في 28 يونيو وانتهت في 25 أغسطس 2016. شارك ما مجموعه 154 فريقًا في المرحلة التأهيلية وجولة المباريات الفاصلة للبت في 22 من الأماكن الـ48 في مرحلة المجموعات من الدوري الأوروبي 2016–17.
كافة الأوقات هي بتوقيت وسط أوروبا الصيفي (ت ع م+2).