المدرسة الحسينية الصغرى، هي أول مدرسة بنيت بمدينة تونس في العهد الحسيني، وهي من المعالم التاريخية للمدينة العتيقة. تقع قرب التربة الصغرى أو الفرعية للبايات الحسينيين زالتي تعرف بتربة الفلاري، وتفتح واجهتها الأصلية على نهج تربة الباي عدد 60، وكانت تلاصقها حنفية عمومية بأول نهج سيدي زهمول
أقيمت المدرسة بعد بضع سنوات من تسلم الباي حسين بن علي مقاليد السلطة في تونس، حيث أقام قرب باب جديد تربة وكتابا ومدرسة سميت بالمدرسة الحسينية الصغرى، وقد بدأت أشغال بنائها عام 1708 لتنتهي بعد سنتين، وقد سميت بالمدرسة الحسينية الصغرى للتفريق بينها وبين المدرسة الحسينية الكبرى التي بناها علي باي.