المجلس العسكري الأعلى ويُعرف أيضا باسم القيادة العسكرية العليا هي أعلى القيادات العسكرية في الجيش السوري الحر. تأسَّس المجلس في وقت متأخر من عام 2012 وبقي قائما حتى منتصف عام 2014. كان يرأس المجلس العميد عبد الكريم الأحمد. أُعلن عن إنشاء المنظمة في 7 كانون الأول/ديسمبر 2012 بدعم من قوى غربية وعربية كوسيلة لتمويل وتسليح الثوار السوريين.
يُؤيد المجلس العسكري الأعلى في الجيش الحر المجلس الوطني السوري. كما يُقر بأن الائتلاف الوطني لقوى الثورة والمعارضة السورية هو «السلطة المدنية» للمعارضة السورية.