تُعد اللجنة الوطنية للابتكار (NCI، الإندونيسية: Komite Inovasi Nasional Republik Indonesia) وكالة حكومية مستقلة على المستوى الرئاسي كانت تتبع رئيس الجمهورية مباشرة. أُنيطت باللجنة مهام تقديم الاستشارات والرؤى العميقة حول البحوث العلمية المتقدمة، والابتكار، والمجالات العلمية والتقانية في مختلف التخصصات لرئيس الدولة ومجلس الوزراء، وذلك من خلال منظومة وطنية شاملة للابتكار.
اتخذت اللجنة من مجمع القصر الوطني في وسط جاكرتا مقراً لها. وقد تأسست الوكالة رسمياً في 20 مايو 2010، وصودق عليها بموجب المرسوم الرئاسي رقم 32 لعام 2010. وبحلول 17 أكتوبر 2014، حُلَّت اللجنة بموجب المرسوم الرئاسي رقم 164 لعام 2014.
وفي عام 2019، شُكِّلت اللجنة التوجيهية للهيئة الوطنية للبحث والابتكار (الإندونيسية: Badan Riset dan Inovasi Nasional) لتكون خلفاً مؤسسياً للجنة الوطنية للابتكار.