القضايا البيئية في إندونيسيا ترتبط القضايا البيئية في إندونيسيا بالكثافة السكانية العالية للبلاد والتصنيع السريع، وغالبًا ما يتم منحها أولوية أقل نظرًا لارتفاع مستويات الفقر والحكم قليل الموارد.
تشمل المشكلات إزالة الغابات على نطاق واسع (معظمها غير قانوني) وحرائق الغابات ذات الصلة التي تتسبب في ضباب كثيف على أجزاء من غرب إندونيسيا وماليزيا وسنغافورة، والإفراط في استغلال الموارد البحرية والمشاكل البيئية المرتبطة بالتوسع الحضري السريع والتنمية الاقتصادية، بما في ذلك تلوث الهواء، والازدحام المروري، وإدارة النفايات، وخدمات المياه ومياه الصرف الصحي الموثوقة.
إن إزالة الغابات وتدمير أراضي الخث تجعل إندونيسيا ثالث أكبر انبعاثات غازات الدفيئة في العالم. يهدد تدمير الموائل بقاء الأنواع الأصلية والمتوطنة، بما في ذلك 140 نوعًا من الثدييات التي حددها الاتحاد العالمي للحفظ على أنها مهددة، و 15 تم تحديدها على أنها مهددة بالانقراض، بما في ذلك قردة سومطرة أورانجوتان.