كان الغزو الإندونيسي لجنوب مالوكو سلسلة من الحملات العسكرية وعمليات مكافحة التمرد اللاحقة التي شنتها القوات المسلحة لجمهورية إندونيسيا ضد جمهورية جنوب مالوكو في أعقاب إعلان الأخيرة استقلالها في 25 أبريل 1950. شهدت مرحلة الغزو الأولية احتلال القوات الإندونيسية سريعاً للجزر الرئيسية مثل بورو، وكاي، وتانيمبار، والمركز الإداري لمدينة أمبون بحلول نوفمبر 1950.
بعد الهزيمة في أمبون، انسحبت حكومة جمهورية جنوب مالوكو وقواتها المتبقية إلى جزيرة سيرام، وبدأت صراع عصابات طويل الأمد استمر لأكثر من عقد من الزمان. استمر التمرد حتى القبض على رئيس جمهورية جنوب مالوكو الدكتور كريس سواموكيل في ديسمبر 1963، على الرغم من استمرار المقاومة منخفضة المستوى بعد ذلك.