تتعاون أذربيجان وإسرائيل تعاونًا مكثفًا منذ عام 1992. أذربيجان هي واحدة من الدول القليلة ذات الأغلبية المسلمة، مع تركيا ومصر والأردن والجمهوريات السوفيتية السابقة، التي تطور العلاقات الاستراتيجية والاقتصادية الثنائية مع إسرائيل.
أشاد إلهام علييف في اجتماع مع رئيس الوزراء الإسرائيلي بنيامين نتانياهو بالدور الفعّال للطائفة اليهودية التي تعيش في أذربيجان في تطوير العلاقات الثنائية بين البلدين.
تربط إسرائيل وجمهورية أذربيجان علاقات وثيقة منذ عام 1992. أذربيجان هي واحدة من الدول الإسلامية القليلة التي أقامت علاقات استراتيجية واقتصادية ثنائية مع إسرائيل . بعد انهيار الاتحاد السوفيتي واستقلال أذربيجان ، كانت إسرائيل من أوائل الدول التي اعترفت بها. أسست إسرائيل سفارتها في باكو عام 1993. تستورد إسرائيل 40٪ من نفطها الخام من أذربيجان وهي أهم مصدر للأسلحة إلى أذربيجان. تشمل صادرات الأسلحة الإسرائيلية إلى أذربيجان الصواريخ وأنظمة الرادار والذخيرة وخاصة الطائرات بدون طيارسوف يكون
تعمل جمهورية أذربيجان على تهدئة العلاقات بين إسرائيل وتركيا. تستخدم إسرائيل أراضي أذربيجان لمراقبة المخابرات الإيرانية.
مواطنو إسرائيل وتركيا هم المواطنون الوحيدون الذين لا يحتاجون إلى تأشيرة لزيارة جمهورية أذربيجان.