كان الدوري الليبي الممتاز 1965–66 النسخة الثالثة من المسابقة التي أسسها الاتحاد الليبي لكرة القدم قبل ثلاث سنوات. وباستخدام النظام المتبع في الموسمين السابقين، اختير الفائزون الثلاثة في البطولات الإقليمية أو «المقاطعات» لتمثيل منطقتهم على المستوى الوطني. الفرق الثلاثة التي تنافست في مسابقة هذا الموسم هي:
الاتحاد «بصفته بطل المقاطعة الغربية؛ تأهل بعد فوزه على الأهلي طرابلس 3–2 في مباراة فاصلة»
هلال سبها «بصفته بطل المقاطعة الجنوبية»
دارنس «بصفته بطل المقاطعة الشرقية»
لعبت هذه الفرق الثلاثة ضد بعضها البعض بنظام الذهاب والإياب لتحديد بطل الدوري الوطني. تُحتَسَب نقطتان للفوز، ونقطة واحدة للتعادل، وصفر للخسارة.