الخوارزمية الثنائية لحساب القاسم المشترك الأكبر، أو خوارزمية GCD الثنائية ، والمعروفة أيضًا باسم خوارزمية Stein أو الخوارزمية الإقليدية الثنائية، هي خوارزمية تحسب القاسم المشترك الأكبر لعددين صحيحين غير سالبين. تستخدم هذه الخوارزمية عمليات حسابية أبسط من الخوارزمية الإقليدية التقليدية، حيث يستبدل القسمة بعمليات حسابية مثل الإزاحات والمقارنات والطرح.
على الرغم من أن الخوارزمية في شكلها المعاصر قد نُشرت لأول مرة من قبل الفيزيائي والمبرمج جوزيف شتاين في عام 1967، إلا أنها ربما كانت معروفة في القرن الثاني قبل الميلاد في الصين القديمة.