الحكومة الاتحادية الانتقالية (بالصومالية: Dowladda Federaalka Kumeelgaarka) اعتُرف بها دوليًا حكومةً مؤقتةً لجمهورية الصومال من أبريل 2004 حتى 20 أغسطس 2012، عندما انتهت ولايتها رسميًا ونُصّبت الحكومة الاتحادية الصومالية.
بعد الحكومة الوطنية الانتقالية، كانت الحكومة الاتحادية الانتقالية هي الإدارة المؤقتة الثانية التي تهدف إلى إعادة المؤسسات الوطنية إلى الصومال بعد انهيار نظام سياد بري عام 1991 والحرب الأهلية التي تلت ذلك.
تأسست الحكومة الاتحادية الانتقالية كواحدة من المؤسسات الاتحادية الانتقالية (TFIs) للحكومة على النحو المحدد في الميثاق الاتحادي الانتقالي (TFC) الذي اعتمده البرلمان الاتحادي الانتقالي (TFP) في نوفمبر 2004.