يعد التطعيم ضد كوفيد-19 في جيبوتي حملة تحصين مستمرة ضد فيروس كورونا 2 المسبب لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة، وهو الفيروس المسبب لمرض فيروس كورونا 2019 (كوفيد-19)، استجابة للجائحة المستمرة في البلاد.
بدأت جيبوتي برنامج التطعيم الخاص بها في 15 آذار 2021، في البداية بـ 24000 جرعة من لقاح كوفيشيلد من شركة أسترازينيكا وُفرت من خلال كوفاكس.