يمكن لتصريف المياه من الصابورة من قبل السفن أن يؤدي إلى آثار سلبية على البيئة البحرية. يخضع صرف مياه الصابورة والرواسب من السفن عالميًا باتفاقية إدارة مياه الصابورة منذ دخوله حيز التنفيذ في سبتمبر 2017. يتحكم به أيضًا من خلال تشريعات وطنية للدول قد تكون منفصلة عن الاتفاقية، كما هو الحال في الولايات المتحدة.
تستخدم سفن الرحلات والناقلات الكبيرة وسفن الشحن الكبيرة كميات ضخمة من مياه الصابورة، تؤخذ غالبًا من المياه الساحلية في منطقة أخرى بعد إطلاق السفن لمياه الصرف أو وضع حمولاتها، وتطلق في الميناء التالي حيثما تحمل شحنة إضافية. يحتوي صرف مياه الصابورة عادةً على عدة أنواع من المواد الحيوية، من بينها نباتات وحيوانات وفيروسات وجراثيم. غالبًا ما تشمل هذه المواد أنواع غير محلية، ومزعجة بيئيًا، وأنواع غريبة عن البيئة التي توضع فيها ما قد يسبب أضرارًا كبيرة بيئيًا واقتصاديًا على الأنظمة البيئية المائية، بالإضافة إلى مشاكل خطيرة على الصحة البشرية تشمل الوفاة.