يرجع تاريخ وجود الدين البهائي في سلوفاكياا إلى نحو عام 1916، عندما دعا عبد البهاء أتباع الدين البهائي إلى نشر العقيدة في مناطق مختلفة من أوروبا، بما في ذلك الأراضي التي تُعرف اليوم بسلوفاكيا، والتي كانت آنذاك جزءًا من الإمبراطورية النمساوية المجرية.
ورغم عدم وضوح تاريخ دخول أول البهائيين إلى سلوفاكيا بشكل دقيق، إلا أن هناك أدلة على وجود أفراد بهائيين في تشيكوسلوفاكيا بحلول عام 1910.
مع نهاية الحقبة الشيوعية في أوروبا الشرقية، ظهرت مؤشرات على نشاط بهائي منتظم في سلوفاكيا ابتداءً من عام 1989. وبعد تفكك الاتحاد السوفييتي في أواخر عام 1991، بدأت المجتمعات البهائية في النمو، بما في ذلك في تشيكوسلوفاكيا، حيث تطورت المؤسسات الإدارية للدين.
في عام 1991، أُنتخب أول جمعية روحية محلية بهائية في العاصمة براتيسلافا، والتي أصبحت أيضًا مقرًا لمدرسة فوريل الدولية.[4] وفي عام 1998، أُسست جمعيتين وطنيتين منفصلتين لجمهوريتي التشيك وسلوفاكيا.
ورغم أن القانون السلوفاكي لا يُلزم الجماعات الدينية بالتسجيل لدى الحكومة، فإن التسجيل مطلوب للقيام بالعديد من الأنشطة الدينية وامتلاك العقارات.[5] في عام 2007، قدّم ممثلو المجتمع البهائي 28,000 توقيع من مؤيدين مواطنين إلى الحكومة السلوفاكية، مما أسفر عن الاعتراف الرسمي بهم كطائفة دينية مسجلة.
ووفقًا لتقديرات جمعية أرشيفات بيانات الأديان بالاستناد إلى الموسوعة المسيحية العالمية، بلغ عدد البهائيين في سلوفاكيا نحو 680 شخصًا في عام 2005.