البطريركية الأرمنية في القدس، وتُعرف أيضاً باسم بطريركية القديس يعقوب للأرمن (بالأرمنية: Առաքելական Աթոռ Սրբոց Յակովբեանց Յերուսաղեմ). هي الكنيسة الرسولية الأرمنية المعترف بها رسمياً في فلسطين، للتنظيم الذاتي لقضايا الأحوال، كالزواج والطلاق وتقع في الحي الأرمني في القدس.
أصبح المطران نورهان مانوكيان، الذي كان سابقاً المطران الأكبر والنائب البطريركي، بطريرك القدس الأرمني رقم 97 في 24 يناير 2013. خلف مانوكيان رئيس الأساقفة توركوم مانوكيان، الذي توفي في 12 أكتوبر 2012، بعد أن أمضى 22 عاماً في منصبه. يشرف البطريرك، إلى جانب مجمع كنسي من سبعة رجال دين منتخبين من قبل جماعة القديس يعقوب، على شؤون البطريركية.
حصل الناجون من مذابح الأرمن خلال الحرب العالمية الأولى، على مأوى في دير الأرمن في القدس. وبلغ عدد سكان القدس الأرمن في ذلك الوقت 25 ألف نسمة. لكن عدم الاستقرار السياسي والاقتصادي في المنطقة أدى إلى انخفاض عددهم. يعيش معظم الأرمن في القدس داخل وحول البطريركية في كاتدرائية القديس يعقوب، الذي يحتل معظم الحي الأرمني في البلدة القديمة. وإلى جانب القدس، هناك مجتمعات أرمنية في يافا وحيفا والناصرة وفي الأراضي الفلسطينية.
تستخدم الطائفة الأرمنية في القدس التقويم اليولياني القديم، على عكس باقي الكنائس الأرمنية التي تستخدم التقويم الغريغوري.