الاحتلال الفرنسي لمالطا استمر من عام 1798 حتى عام 1800. وقد بدأ هذا الاحتلال عندما استسلمت جماعة القديس يوحنا لنابليون بونابرت عقب الإنزال الفرنسي في يونيو عام 1798. أسس الفرنسيون تقليدًا دستوريًا في تاريخ مالطا (كجزء من الجمهورية الفرنسية)، منح التعليم المجاني للجميع، وحرية الصحافة الراسخة نظريًا، على الرغم من أن الصحيفة الموالية للفرنسيين جورنال دي مالتي هي التي كانت تنشر أثناء الاحتلال.
ألغى الفرنسيون طبقة النبلاء والعبودية والنظام الإقطاعي ومحاكم التفتيش. وكان التذكير المعماري الوحيد المتبقي بالاحتلال الفرنسي هو على الأرجح تشويه معظم شعارات النبالة على واجهات مباني الفرسان. سرعان ما تمرد المالطيون ضد الفرنسيين وقادوا الحامية الفرنسية إلى فاليتا وتحصينات غراند هاربور حيث حوصروا لأكثر من عامين. سلم الفرنسيون مالطا حين كانت إمداداتهم الغذائية على وشك النفاد.