الاعتلال المعوي أو اعتلال الأمعاء (بالإنجليزية: Enteropathy) مصطلح طبي يشير إلى أي حالة مرضية في الأمعاء.
يستعمل مصطلح التهاب الأمعاء للتعبير عن إصابة الأمعاء بالتهاب، وهو تعبير دقيق لأحد أنواع الاعتلال المعوي، لكن المصطلحين يستعملان عادة بشكل متبادل.