وفي عام 2009، اندلعت اشتباكات بين الفلسطينيين المسلمين والشرطة الإسرائيلية في 27 سبتمبر/أيلول 2009، واستمرت حتى أواخر أكتوبر/تشرين الأول. انتشر العنف في القدس الشرقية وأجزاء من الضفة الغربية، وشمل إلقاء زجاجات المولوتوف والحجارة على قوات الأمن الإسرائيلية والمدنيين. وردت الشرطة الإسرائيلية باعتقال عدد من مثيري الشغب وفرض قيود متفرقة على الوصول إلى الحرم القدسي على أساس السن. وأصيب عشرات من مثيري الشغب ورجال الشرطة والمدنيين الإسرائيليين.
يقع المسجد الأقصى فوق الحرم القدسي الشريف، وهو أقدس موقع في اليهودية، وهو أيضًا موقع المسجد الأقصى وقبة الصخرة، وهو ثالث أقدس موقع في الإسلام. حصلت إسرائيل على السيطرة على الحرم القدسي في عام 1967 من الأردن، ودمجته مع بقية القدس الشرقية في عاصمتها (غير المعترف بها إلى حد كبير) القدس ؛ وتتم إدارة الأماكن المقدسة الإسلامية على الحرم القدسي من قبل الأوقاف الإسلامية، في حين تتولى إسرائيل المسؤولية عن الإدارة العامة. ومن المعتقد بشكل عام أن الوضع الدائم للحرم القدسي سيتم تحديده من خلال المفاوضات المستقبلية بين إسرائيل والسلطة الفلسطينية.