تأسس الاتحاد الكيني لكرة القدم في عام 1960م وانضم إلى الإتحاد الدولي لكرة القدم في 1960م وإنضم إلى الاتحاد الأفريقي لكرة القدم في 1968م.
في نوفمبر 2022 ، رفع الفيفا التعليق عن الاتحاد الكيني لكرة القدم (FKF)، بعد قرار الحكومة المحلية بإعادة الهيئة بعد حلها للاشتباه في الفساد.