إن الموارد المائية في فلسطين تقع تحت سيطرة إسرائيل الكاملة، ويخضع تقسيم المياه الجوفية لأحكام اتفاقية أوسلو الثانية.
وبشكل عام فإن جودة المياه في قطاع غزة أسوأ بكثير مقارنة بالضفة الغربية. يفقد ما يقرب من ثلث إلى نصف المياه الموزعة في الأراضي الفلسطينية في شبكة التوزيع. لقد تسبب الحصار المستمر لقطاع غزة وحرب غزة (2008-2009) في أضرار جسيمة للبنية التحتية في قطاع غزة. وفيما يتعلق بمياه الصرف الصحي، فإن محطات المعالجة الحالية لا تمتلك القدرة على معالجة كل مياه الصرف الصحي المنتجة، مما يتسبب في تلوث المياه بشكل خطير. ويعتمد تطوير القطاع بشكل كبير على التمويل الخارجي.