إدارة النظام البيئي هي عملية تهدف إلى الحفاظ على خدمات النظام البيئي الرئيسية واستعادة الموارد الطبيعية مع تلبية الاحتياجات الاجتماعية الاقتصادية والسياسية والثقافية للأجيال الحالية والمقبلة.
الهدف الرئيسي من إدارة النظام البيئي هو الرعاية الفعالة والاستخدام الأخلاقي للموارد الطبيعية. إدارة النظام البيئي هي نهج متعدد الأوجه وكلي يتطلب تغييرًا كبيرًا في كيفية تحديد البيئات الطبيعية والبشرية.
تشارك عدة مناهج للإدارة الفعالة للنظام البيئي في جهود الحفظ على المستويين المحلي والإقليمي، وتشمل الإدارة التكيفية، وإدارة الموارد الطبيعية، والإدارة الاستراتيجية، وإدارة القيادة والتحكم.