شيكونغونيا هو فيروس ألفا ينتقل عن طريق البعوض وتم عزله لأول مرة بعد تفشيه عام 1952 في تنزانيا الحديثة.
إنتشر الفيروس في مناطق الغابات في أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى في دورات تشمل مضيفين من الرئيسيات غير البشرية وناقلات البعوض الشجرية. تشير الدراسات التطورية إلى أن دورة الانتقال الحضرية - انتقال مسببات الأمراض بين البشر والبعوض الموجود في البيئات الحضرية - تم تأسيسها في مناسبات متعددة من السلالات الموجودة في النصف الشرقي من أفريقيا في مضيفات الرئيسيات غير البشرية. ربما بدأ هذا الظهور والانتشار خارج أفريقيا في وقت مبكر من القرن الثامن عشر.
لا تشير البيانات المتاحة حاليًا إلى ما إذا كان إدخال حمى شيكونغونيا إلى آسيا قد حدث في القرن التاسع عشر أو في الآونة الأخيرة، ولكن هذه السلالة الآسيوية الوبائية تسبب تفشي المرض في الهند وتستمر في الانتشار في جنوب شرق آسيا.
حدثت عدة حالات تفشي لمرض شيكونغونيا منذ عام 2005. ومع ذلك، وفقًا لأحدث البيانات المتاحة، لم تبلغ البلدان المتقدمة بعد عن حالة مؤكدة محلية للإصابة بمرض شيكونغونيا. يشير تحليل الشفرة الوراثية لفيروس شيكونغونيا إلى أن زيادة شدة تفشي المرض في الفترة من 2005 إلى الوقت الحاضر قد تكون بسبب تغيير في التسلسل الجيني، مما يؤدي إلى تغيير بروتين الغلاف الفيروسي للفيروس، مما يسمح له بالتكاثر بسهولة أكبر في خلايا البعوض. ويسمح هذا التغيير للفيروس باستخدام بعوض النمر الآسيوي ( نوع غازي ) كناقل بالإضافة إلى الناقل الرئيسي الاستوائي الأكثر صرامة، وهو بعوض الزاعجة المصرية . في يوليو 2006، قام فريق بتحليل الحمض النووي الريبي للفيروس وتحديد التغيرات الجينية التي حدثت في سلالات مختلفة من الفيروس وتحديد التسلسلات الجينية التي أدت إلى زيادة ضراوة السلالات الأخيرة. فيروس الشيكونغونيا CHIKV هو فيروس صغير مغلف مما يجعله جزءًا من عائلة الفيروسات ألفا Togaviridae . تعمل هذه الخاصية على تحسين قدرة الفيروسات على دخول الجسم والتأثير على الأشخاص الأكثر عرضة مثل الأفراد الذين تزيد أعمارهم عن 65 عامًا والأفراد الذين يعانون من حالات طبية أساسية.
وُجِد ولسبب غير معروف أن الأفراد الذين تقل أعمارهم عن 30 عامًا لديهم وقت تعافي أسرع.
في المتوسط، يكون معدل الوفيات بسبب تفشي مرض شيكونغونيا منخفضًا. نظرًا لأنه مرض غير مميت بشكل عام، فإن معدلات الانتشار خلال معظم حالات تفشي المرض تكون أعلى من معدلات الإصابة. في الآونة الأخيرة، تم اكتشاف أن ما يقرب من 39% من سكان العالم يقيمون في بيئات يتوطن فيها فيروس شيكونغونيا. وقد أدت طفرات انتقال العدوى إلى زيادة حالات الوفاة في جميع أنحاء العالم إلى 350 شخصًا سنويًا اعتبارًا من أكتوبر 2023 إلى 87 حالة وفاة في عام 2022. لقد قامت دراسات قليلة بالتحقيق بشكل شامل في المخاطر التي يتعرض لها الأشخاص الذين يعيشون في مناطق غير كافية طبياً، ولكن بعض الدراسات تشير إلى ارتفاع معدلات التأثيرات المزمنة. وقد تساهم التحديات المتعلقة بالموظفين والتمويل في البلدان الأقل نمواً في عدم الإبلاغ عن الحالات. تشير البيانات الحالية حول الأمراض المصاحبة لعدوى شيكونغونيا إلى أن الأفراد الذين يعانون من حالات شديدة من شيكونغونيا لديهم انتشار متزايد لأمراض القلب جنبًا إلى جنب مع مرض السكري وصعوبات الجهاز التنفسي. باستثناء الربو، فإن خطر الإصابة بكل حالة متزامنة مع عدوى فيروس شيكونغونيا يزداد مع تقدم العمر. في حين لا تزال الآثار طويلة الأمد بحاجة إلى التحقيق، في المتوسط، يعاني 40% من الأفراد المصابين بعدوى فيروس شيكونغونيا المتعددة من إعاقات مستمرة بعد 6 أشهر ويظل 28% من الأشخاص يعانون منها بعد 18 شهرًا. تشير الدراسات الحديثة إلى وجود علاقة بين ارتفاع معدلات الإصابة بفيروس شيكونغونيا وعوامل الخطر بما في ذلك الأفراد الذين عانوا سابقًا من آلام وحالات مرتبطة بالمفاصل، وأولئك الذين تتراوح أعمارهم بين 45 عامًا وما فوق، والأفراد من الجنس الأنثوي.