أمر الكوماندوز (بالألمانية: Kommandobefehl) صدر عن القيادة العليا للفيرماخت، القيادة العليا للقوات المسلحة الألمانية، في 18 أكتوبر 1942 موضحًا أنه انتقاما من معارضيه "الذين يوظفون في سلوكهم للحرب، الطرق التي تتعارض مع اتفاقية جنيف الدولية"، بما في ذلك من "أسر" يأمر "بالظهور" بتوجيه تعليمات إليهم ليس فقط بربط السجناء، ولكن أيضًا بقتل الأسرى غير المسلحين الذين يعتقدون أنهم قد يثبتون عليهم أو يعرقلهم في تنفيذ أهدافهم بنجاح "، وذلك وقد أمرت قوات الكوماندوس بقتل السجناء، يجب قتل جميع قوات الكوماندوز المتحالفة التي واجهت في أوروبا وإفريقيا على الفور دون محاكمة، حتى لو كانوا يرتدون الزي الرسمي المناسب أو إذا حاولوا الاستسلام. كان أي كوماندوز أو مجموعة صغيرة من الكوماندوز أو وحدة مماثلة، عملاء، ومخربين لا يرتدون الزي الرسمي، الذين سقطوا في أيدي القوات الألمانية بوسائل أخرى غير القتال المباشر (من خلال الشرطة في الأراضي المحتلة)، ليتم تسليمها على الفور إلى الشرطة الأمنية الألمانية.
أوضح الأمر، الذي صدر سراً، أن الإخفاق في تنفيذ توجيهاته من قبل أي قائد أو ضابط سيعتبر عملاً من الإهمال يعاقب عليه بموجب القانون العسكري الألماني. كان هذا في الواقع «أمر الكوماندوز» الثاني، الأول الذي أصدره فيلد مارشال (ألمانيا) جيرد فون روندستيدت في 21 يوليو 1942، الذي ينص على أنه ينبغي تسليم المظليين إلى الجستابو. بعد وقت قصير من الحرب العالمية الثانية، في محاكمات نورمبرغ، وُجد أن أمر الكوماندوز يعد خرقًا مباشرًا لقوانين الحرب، وأُدين الضباط الألمان الذين نفذوا عمليات إعدام غير قانونية بموجب أمر الكوماندوس بارتكاب جرائم حرب وحُكم عليهم بالإعدام، أو في حالتين، تمديد الحبس.