استعملت اللغة الطاجيكية خلال التاريخ ثلاث أبجديات في الكتابة: الأبجدية العربية، وألفبائية لاتينية، نظام الأبجدية السيريلية. وأي من هذه الكتابات اعتبرت أبجدية طاجيكية، وهي تكتب كالآتي: عرب-فارسية: الفبای تاجيكی، سيريلية: алифбои тоҷикӣ، لاتينية: alifʙoi toçikī، فارسية: الفبای تاجیکی.
واستعمال هذه اللغة هذه الأنظمة المختلفة مرتبط بالمراحل التي مرت بها المنطقة خلال التاريخ، بالعربية أولا، ثم اللاتينية لفترة معينة ومن بعدها السيريلية، وهي الأبجدية الأكثر شيوعا في طاجيكستان.اللغة مقاربة، وهي اللغة البخارية العبرانية والتي تستعمل على يد يهود بخارى، تستعمل الكتابة العبرية.